Habitada originalmente pelos indígenas tupinambás, um de seus primeiros nomes era o de Ilha dos Cururupebas, em virtude do cacique tupinambá Cururupeba que habitava nessa ilha e, após anos de resistência, ter sucumbido às investidas dos colonizadores portugueses no século XVI.[5]
Em 1698, as autoridades coloniais criaram um distrito para organizar administrativamente a ilha. Este distrito recebeu um nome de Madre de Deus do Boqueirão.